降维不仅仅是为了数据可视化。它还可以识别高维空间中的关键结构并将它们保存在低维嵌入中来克服“维度诅咒” 本文将介绍一种流行的降维技术Uniform Manifold Approximation and Projection (UMAP)的内部工作原理,并提供一个 Python 示例。 (UMAP) 如何工作的? 分析 UMAP ...
研究人员开发了名为GAUDI的非线性无监督多组学整合方法,通过独立UMAP嵌入和HDBSCAN聚类,解决了传统线性方法难以捕捉组学间复杂关系的问题。该方法在模拟和真实数据(如TCGA癌症数据集)中均表现出色,能精准识别高危患者群体(如AML中生存期仅89天的亚群 ...
本研究针对虚拟筛选(VS)中传统数据分割方法(如随机分割、骨架分割和Butina聚类)高估AI模型性能的问题,提出基于UMAP的聚类 ...
Sometimes, in the quest for new data, scientists forget that existing datasets can be treasure troves for new discoveries. One such undermined scientific gem is transcriptomic data from the human ...
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