NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析 （Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析 （ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析 (重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘 ...

循环游离 RNA（cfRNA）是一类存在于血液中的短片段 RNA，被认为来自机体细胞凋亡、组织更新或外泌体释放。然而，cfRNA 易被 RNA 酶降解、含量低、片段短，长期以来它并不被视为液体活检的理想材料。 2025 年 7 月 8 日，芝加哥大学何川教授团队、香港科技大学张 ...

本项目利用RNA-Seq技术对气道组织样本进行基因表达分析，通过建立完整的生物信息学分析流程，从原始数据下载到基因表达定量，实现了对高通量测序数据的系统处理。流程涵盖数据质量控制、数据修剪、序列比对和基因表达量计算等关键步骤，为后续的差异 ...

在 RNA 测序（RNA-seq）用于真菌研究时，内参基因选择影响数据准确性。研究人员分析曲霉属黑曲霉（Aspergillus niger）转录组数据，鉴定出 44 个候选内参基因，其中 26 个在多种真菌中表达稳定，优于传统内参基因，有助于提升转录组数据标准化分析。 在生命科学 ...

之前整理的一篇大综述 — Nature重磅综述 |关于RNA-seq，你想知道的都在这收到了热烈反响，阅读人数过万。 行文很长，最后精炼下来的文字近三万，适合深度阅读思考。 上次发出时，有读者留言说部分专业名词不理解。为了方便理解和对综述有个概览，特整理了 ...

RNA测序（RNA-seq）在过往十年里逐渐成为全转录组水平分析差异基因表达和研究mRNA差异剪接必不可少的工具。RNA-seq帮助大家对RNA生物学的理解会越来越全面：从转录本在何时何地转录到RNA折叠以及分子互作发挥功能等。 1.RNA-seq相关名词详细介绍了RNA seq的专业词 ...

肿瘤微环境（TME）调节着肿瘤的生存、维持、生长和免疫监测，在疾病进展和治疗反应中起着重要作用，如局部耐药、免疫逃逸和癌症转移等。阐明不同细胞群中TME细胞的组成及其功能有助于探索更有效的肿瘤治疗方法。 批量RNA测序（bulk RNA-seq）可以在给定时间 ...

近年来，高通量测序技术已经彻底改变了生物学和医学等学科的研究方式，使得在单碱基水平上对大量样本的核苷酸序列进行检测成为可能。 近年来，高通量测序技术已经彻底改变了生物学和医学等学科的研究方式，使得在单碱基水平上对大量样本的核苷酸序列 ...

随着高通量测序技术的发展，转录组测序（RNA-seq）已成为系统研究基因转录及转录后水平调控状态的常规方法，并在多个物种中得到广泛应用。海量转录组数据以前所未有的速度产生，以数据驱动为导向的大规模数据整合、挖掘与解析面临挑战。为更充分展现 ...

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